関戸さんに質問です
Shogo Saito
2020/10/2
2020/10/2
まずはコメントから
全体の流れがきれいであったため、話が入ってきやすかったです。
ただ、田中先生からご指摘がありましたが、イントロにもっと深みをもたせるとよかったと思います。
質問です。
アミノ酸の体積、というパラメータが出てきていましたが、どのように求めてるんですか？
分子の体積の求め方が分からないです。
電子軌道とかがどうなっているのか知りたいです。
コメント
分子動力学（MD）シミュレーションで、1個の原子に他の原子から及ぶ力を計算する。原子間に働く力には、原子が分子をつくるときの化学結合、原子がプラスやマイナスの電気を帯びていることによる静電気力、分子間力などこれらをすべて合計する。これによってアミノ酸の構造が決定するため、体積もシミュレーション結果として得られる、という流れだと思います。電子軌道に関しても論文にデータが載ってないので、答えることができません。